作者：范素瑋 / 臺灣大學生態學與演化生物學所博士候選人
R是什麼？事實上R language就是「新的S語言」。承襲S語言的設計理念，它是一個整合型的資料處理軟體及統計軟體，也具有陣列及矩陣的演算能力及展示的繪圖工具，及簡單容易的程式設計語言，便於進行資料篩選、反覆演算、匯入/匯出資料及開發自訂程式功能。
R是什麼？
「The R environment」是由S語言所轉變而來，由貝爾實驗室的John Chambers最初所設計，繼而有Douglas Bates, Rick Becker, Bill Cleveland, Trevor Hastie, Daryl Pregibon 及Allan Wilks等人所實踐落實及修改。所以事實上R language就是「新的S語言」。承襲S語言的設計理念，它是一個整合型的資料處理軟體及統計軟體，同時也是繪圖軟體。
R最初是由來自紐西蘭奧克蘭大學的Ross Ihaka和Robert Gentleman開發，也因此稱為R。現在則由所謂的「R開發核心團隊」負責。R大致上的語言方式與S或S-plus語言相通，最大的不同乃在於結果的輸出，R僅會顯示最少的訊息，但可以將想要輸出結果儲存為一個物件(object)，以提供後續演算，這也是與許多統計軟體如：SAS、SPSS不同的地方。
由於它是免付費的公開軟體，原始碼也可自由下載使用，在加上十分容易在官方網站(http://www.r-project.org/)找到別人寫好的套件(Package)或分析程式碼，因此近年來使用的人越來越多，並且不乏許多專業人士如：風險分析師、研究學者、統計學家等。R能快速的擴張歸功於它的物件導向功能，具有執行使用者自訂功能及Package的能力。另外他在程式語彙上的彈性也是容易編輯也成為擴展的優點。
R language的基本安裝及套件安裝
你可以在R的官方網站(http://www.r-project.org/)的「CRAN」，得到針對Unix、Macintosh或Windows的安裝軟體及原始碼。安裝程式下載後即可以安裝。安裝後執行開啟，就會看到下面的視窗。
在編輯中的「GUI偏好設定」改變視窗顯示的設定，如字型、字的大小、顏色等；使用「清除主控台」或是Ctrl+L可以清除視窗，但在中文windows系統下，如果想要改變選單語言是較為困難的，核心團隊說明這是因為語系為作業系統所控制，無論安裝時選取哪種語系，都會呈現中文選單。並且由於中文化也並不完全，對某些人來說就得忍受中英文夾雜的訊息。
在基本安裝後，R平台中已經具有約25個基本套件(Base package)，包含常用的敘述統計運算，如：平均數(mean)、標準差(stand deviation)、頻度分布圖(histogram)、回歸分析(regression)等等。這裡所指的套件(Package)就是系統中建置好的指令組合，為某些資料分析目的所設計的一連串指令，可能是由核心團隊所釋出，也有許多是R language的喜好者所貢獻。在R的官方網站CRAN mirror的「Package」中，有數百種套件可提供提供下載安裝。
在R平台上安裝套件的方式有兩種：
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可以利用「程式套件」中的「安裝程式套件」選擇最靠近你所在地的CRAN mirror (Taiwan Taichung 或 Taiwan Taipei)後，即會出現依照英文字母次序排列的套件選單，可以選取多個套件同時進行安裝。
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另一個方式是由CRAN mirror網頁中，contrib下載 .zip的安裝檔儲存後，利用「用本機的zip檔案來安裝程式套件」進行安裝。而要於主控台執行套件的指令前，必須先將套件載入，可以利用「程式套件」中的「載入程式套件」選取套件名稱進行載入，或是直接在主控台指令列上利用library()輸入套件名稱來載入。
不同版本的R平台有其相容的套件，有些新的套件可能無法向下相容，安裝時如果有版本的問題，在主控台視窗上會看到一些警告訊息，不一定表示程式一定不能執行，但執行的結果可能會有錯誤，要特別注意。如果有非用不可的理由，也可以參考「R Installation and Administration」手冊中的「Add-on Packages」；同時也可以在http://www.murdoch-sutherland.com/Rtools/下載一些工具進行偵測，並且執行輔助範例(example in help)來確定程式無誤。如果需要修改可以參考「Writing R Extension」手冊，查看如何進行套件的編輯。R官方網站(http://www.r-project.org/)的「Manuals」有各式使用手冊提供參考。
簡單的R指令
在R平台上是使用指令列來進行分析的操作，指令輸入後結果將於下方呈現。如果你想要將運算的結果儲存起來，可以將演算式或是物件(object)指定到自訂的特定名稱中。「<-」或 「=」為指定符號。
如：
R的計算及邏輯符號
「+」、「-」、「*」、「/」分別表示加、減、乘、除，「^」表示次方，運算符號與其他程式相仿。「%*%」表示進行矩陣相乘；「%o%」表示對兩的向量(vector)進行外積(outer product)計算，他也可以outer()這個指令來進行，如果我們將兩個物件之間的運算改掉時，則有不同的結果。在R語言中同樣可以使用科學符號來表示數字，如：15e-11。
「&」、「|」為邏輯運算中的且及或，「>」、「<」、「>=」、「<=」，為大於、小於及大於等於和小於等於，而等於及不等於分別以「==」和「!=」。
R對NA值的處理
如果您的資料具有缺值時，在R中可以NA來表示缺值(missing value)，此時應該要特別注意所執行的演算將如何處理缺值；部分指定會忽略它，如：繪圖plot()；但多數可能會造成無法演算，如：平均值計算mean()、最小值計算min()。無法計算時，你可以使用na.omit()來整理資料表格，或以na.rm=TRUE於指令中指定NA值得處理方式。
R迴圈的寫法
在R之中迴圈的書寫方式同樣也有許多種，如for(i in 1:30){…..}表示將i由1執行到30及有三十個迴圈。repeat{…..}則將會執行無窮次，可以break來進行中斷，通常我們會加上判斷式if(){…..}來，控制片段的時間點，if(){…..}通常也與else{…..}，並且可以在其中夾帶多次。R語言的另一個方便之處在於他可以將數個指令夾雜連用，就像四則運算中的括號，會將月內層的括號先行運算。
續...R language簡介(下)