歷史沿革
為整合校內各漁業科學教學研究單位，強化及拓展漁業科學研究領域，開發新技術以解決產業問題及促進漁業發展，遂於民國 68 年申請農復會（現為農委會）經費補助，籌建「漁業科學館」；並在理學院架構下於民國 75 年成立「漁業科學研究所」，由郭欽明(榮譽教授)擔任第一任所長，招收漁業資源與水產養殖碩士班研究生，民國 86 年成立博士班，隨著本校生命科學院與生命科學系的籌設，本所也在 92 年度轉入生命科學院，並參與生命科學系的教學訓練課程。
漁業科學研究所成立之宗旨，是為台灣負起基礎水生生物科學的教學與研究而設立的研究所，30幾年來培育了無數具有多元領域專業能力與宏觀視野的水生生命科學及資源管理人才，提供政府所需的優質公務人員以及產學界所需的漁業科技應用人才，同時也著重領域發展的均衡性，並加強與國內外研究機構之交流和合作，以期達到國際漁業科學研究水準。
Eduction and Direction
Major goals of the institute in education and research, evolving from the fundamental aquatic and fishery biology, are to develop the modern biotechnology and disease control in raising the production of fishery products. The concepts of environmental conservation and resources of environmental conservation and resource management are also enhanced to consider the equilibrium of the entire ecosystem. Meanwhile, innovated technologies developed in the laboratory are transferred to the marine biotech-industry to improve the aquaculture products, production and sustainable utilization of aquatic life resources.